Fakültemiz 11 Nisan 1975 tarih ve 1873 sayılı kanunla Selçuk Üniversitesinin fakültelerinden birisi olarak kurulmuştur. Kuruluşunda açılan Botanik, Zooloji, Matematik, Fizik Mühendisliği, Jeoloji Mühendisliği ve Kimya Mühendisliği Bölümlerine 1976-1977 eğitim-öğretim yılında ilk öğrencilerini alarak eğitim-öğretim faaliyetine başlamıştır. Mühendislik bölümleri 1982 yılında Yükseköğretim mevzuatına uygun olarak Mühendislik-Mimarlık Fakültesine bağlanmıştır. 28 Mart 1983 tarih ve 2809 sayılı Yükseköğretim Kurumları Teşkilatı kanunuyla Edebiyat Fakültesi ile birleştirilmiştir. 1984 yılında Fizik ve Kimya Bölümleri açılmıştır. 1997 yılında İstatistik Bölümü açılmıştır. 2005 yılında MontanaState Üniversitesi (ABD) ile ortak çift diplomalı Biyokimya (Seçmeli Kimya) Bölümü açılmıştır. 03.12.2008 tarihine kadar Fen-Edebiyat Fakültesi adıyla varlığını sürdürmüştür. 03.12.2008 tarih ve 27073 sayılı Resmi Gazete yayınlanan 10.11.2008 tarih ve 2008/14344 sayılı KHK (Bakanlar Kurulu Kararı) ile ayrılarak Fen Fakültesi olmuştur. Bugün, Biyoloji,Biyoteknoloji, Fizik, İstatistik, Kimya, Matematik. Aktüerya ve Biyokimya bölümleri olmak üzere 8 bölümümüzle eğitim öğretime devam etmekteyiz.  1597 öğrenci, 161 akademik personel, 35 idari personel ile eğitim-öğretim ve araştırma faaliyetlerine devam etmektedir.