22 Kasım 2001 tarihli Resmi Gazetede yayımlanan Bakanlar Kurulu Kararı ile Selçuk Üniversitesi bünyesinde Selçuklu Tıp Fakültesi adıyla ikinci bir tıp fakültesi kurulmuştur. Fakültenin kurucu dekanı olarak 06.09.2002 tarihinde Prof.Dr.M.İ.Safa KAPICIOĞLU atanmıştır.

11 Aralık 2002 tarihli Resmi Gazetede Selçuk üniversitesi Sağlık Araştırma ve Uygulama Merkezi (Selçuklu Tıp Fakültesi Hastanesi) Yönetmeliği yayımlanmıştır.

2002-2003 ders yılında fakülte, ilk öğrencilerini almış, bu öğrenciler Selçuk Üniversitesinin diğer tıp fakültesi olan Meram Tıp Fakültesi öğrencileri ile birlikte eğitim almıştır.

02.01.2004-19.04.2007 tarihleri arasında dekanlık görevini Prof.Dr.Kemal GÜNDÜZ, 19.04.2007-13.08.2008 tarihleri arasında vekaleten Rektör Prof.Dr.Süleyman OKUDAN yürütmüştür.

13.08.2008-07.11.2011 tarihleri arasında Prof.Dr.A.Kağan KARABULUT, 07.11.2011-21.03.2012 tarihleri arasında ise vekaleten Prof.Dr.Serdar GÖKTAŞ dekan olmuştur.

2009-2010 ders yılından itibaren öğrencilerimiz eğitimlerini tamamen şimdiki fakülte binasında almaya başlamışlardır.

27 Aralık 2011 tarihinde Bakanlar Kurulu Kararı ile Meram Tıp Fakültesi de dahil olmak üzere Selçuk Üniversitesinin bazı fakülteleri Konya Üniversitesi şimdiki adıyla Konya Necmettin Erbakan Üniversitesine devredilmiş, böylece Selçuk Üniversitesinin tek tıp fakültesi kalmıştır.

10 Eylül 2012 tarihinde ise Bakanlar Kurulu Kararı ile "Selçuklu Tıp Fakültesi" ismi "Tıp Fakültesi" olarak değiştirilmiştir. Fakültemiz şu ana kadar 7 dönem mezun vermiştir. Öğrenci sayımız 1200ü aşmış durumdadır.

2 Ocak 2013 tarihi itibariyle Tıp Eğitimi Programlarını Değerlendirme ve Akreditasyon Derneğine, mezuniyet öncesi Ulusal Tıp Eğitimi Akreditasyonu (UTEAK) için başvurusu yapılmıştır.

Fakültemiz 25 Nisan 2015 tarihi itibariyle Mezuniyet Öncesi Tıp Eğitimi Programının Ulusal Tıp Eğitimi Akreditasyon Kurulu (UTEAK) tarafından 01.01.2021 tarihine kadar akredite edilmiştir.

29.01.2016-21.07.2020 tarihleri arasında Üroloji Anabilim Dalı Öğretim Üyesi Prof.Dr.Serdar GÖKTAŞ dekanlık görevini yürütmüştür. 

Fakülte Dekanlığı görevini, 21.07.2020 tarhinden itibaren Ruh Sağlığı ve Hastalıkları Öğretim Üyesi Prof. Dr. Yavuz SELVİ, Dekan Yardımcılığı görevini Anesteziyoloji ve Reanimasyon Anabilim Dalı Öğretim Üyesi Prof.Dr.İnci KARA ile Anatomi Anabilim Dalı Öğretim üyesi Prof. Dr. Nadire ÜNVER DOĞAN yürütmektedir. Fakülte Sekreteri Mahmut KESİK'dir.